邓子新（1957—），湖北房县人。微生物学家。上海交通大学教授。1982年毕业于华中农业大学微生物专业，1987年获英国EastAnglia大学分子微生物学博士学位。现任上海交通大学Bio-X生命科学研究中心副主任，兼任5个国际刊物编委。 长期从事微生物分子生物学研究，在重要类别抗生素生物合成基因克隆、定位、结构功能分析、表达和遗传调控机制、抗生素代谢工程与药物创新、天然产物的生物化学与组合生物合成等方面取得了系统性研究进展,提出了多个国际认同的抗生素生物合成分子机制的理论模型,利用遗传操作高产了重要抗生素，并产生了系列药物衍生物，是我国在微生物代谢途径与代谢工程研究领域的主要学术带头人之一。在众多细菌DNA大分子上首次发现了硫(S)修饰，打开了DNA硫化修饰新领域。

2005年当选为中国科学院院士。